Comparison of the effectiveness of the standard ELISA test and qRT-PCR using the TaqMan probe to assess the infection of sugar beet (Beta vulgaris sbsp. vulgaris) plants with rhizomania virus

Rizomania jest jedną z najpoważniejszych chorób buraka cukrowego (Beta vulgaris subsp. vulgaris) powodującą ogromne straty plonów. Przyczyną rizomanii jest porażenie wirusem żółtaczki nerwów buraka (ang. Beet necrotic yellow vein virus, BNYVV). Najczęściej stosowanym sposobem oceny zawirusowania roślin buraka cukrowego BNYVV jest standardowy test ELISA (ang. Enzyme-Linked Immunosorbent Assay). Metoda ta, ma jednak poważne ograniczenia takie jak czasochłonność, wysokie koszty i niska czułość. Celem niniejszej pracy było porównanie skuteczności metody qRT-PCR z wykorzystaniem starterów i sondy TaqMan komplementarnych do RNA3 BNYVV z wynikami otrzymanymi metodą standardową. Wykazano, że metoda qRT-PCR jest efektywna w ocenie zawirusowania i wykazuje większą czułość.

Rhizomania is one of the most devastating sugar beet (Beta vulgaris subsp. vulgaris) diseases causing severe yield losses. It is caused by Beet necrotic yellow vein virus (BNYVV). The most commonly used method of quantification of rhizomania virus is a standard ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) test. This method however is particularly time-consuming and expensive. The aim of this study was to compare the efficiency of the qRT-PCR method using primers and TaqMan probe complementary to RNA3 of BNYVV with the results obtained by the standard method. We determined that the method based on qRT-PCR was an effective way of virus quantification, and was more sensitive than standard ELISA assay.