Wydajna implementacja algorytmów przetwarzania obrazów w postaci wtyczek programowych dla środowiska ImageJ

Niniejszy artykuł traktuje o implementacji dodatkowych funkcjonalności w środowisku ImageJ na przykładzie wybranego algorytmu przetwarzania obrazów. Środowisko to jest bardzo popularne wśród naukowców, szczególnie neurobiologów jako referencyjna aplikacja do analizy obrazów preparatów mikroskopowych. W artykule przedstawiono wybrane aspekty charakterystyki prezentowanego środowiska, skupiono się zaś szczególnie na sposobie wdrażania nowych funkcjonal-ności na przykładzie implementacji algorytmu statystycznej dominacji. Rozważono szczegóły wydajnościowe rozwiązania wraz z dyskusją metodyki zrównoleglenia, przedstawiając wyniki eksperymentalne.

---

This article presents an implementation of additional functionality in the ImageJ environment for selected image processing algorithm. This environment is very popular among scientists, especially neuroscientists as a reference application for the analysis of images of microscopic images. The article presents some aspects of the characteristics of presented environment, and focuses particularly on ways of implementing new functionalities as an example the statistical dominance algorithm implementation. The details of performance solutions with discussion of the parallelization methodology, including experimental results, are considered.