Investigating the mechanism of transcriptional memory in Mammalian cells

Poniższe badania zajmą się mechanizmami dziedziczenia epigenetycznego poprzez badanie pamięci transkrypcyjnej w systemie metabolicznym. Celem jest zidentyfikowanie czynników, które pośredniczą w utrzymywaniu i dziedziczeniu stanów transkrypcyjnych poprzez podziały komórkowe. Eksperyment koncentrował się na metabolizmie w wątrobie.Wybraliśmy ludzką linię komórkową wątroby, Huh7. Aby potwierdzić pamięć transkrypcyjną w różnych punktach czasowych, zmierzono poziom transkrypcji PCK2 (fosfomolopirogronian karboksychinaza 2, mitochondria) po głodzeniu przez 24 godziny i cykle powtórne. Ekspresję białka określono na poziomie transkrypcji za pomocą PCR, qPCR i na poziomie białka stosując Western blot i IF.Stwierdziliśmy, że PCK2 przejawia definicję pamięci w odpowiedzi na głód Glukozy.

The following research will address the mechanisms of epigenetic inheritance by studying the transcriptional memory in a metabolic system. The goal is to identify the factors that are mediating the maintenance and inheritance of transcriptional states through cellular divisions. The experiment was focused on metabolism in liver.We chose the human liver cell line, Huh7. To confirm the transcriptional memory at different time points we measured transcription level of PCK2 (Phosphoenolpyruvate carboxykinase 2, mitochondrial) after starvation for 24 hrs and refeeding cycles. Protein expression was determined at the transcription level using PCR, qPCR, and at the protein level using Western blot and IF. We have found that PCK2 exhibited the definition of memory in response to Glucose starvation.