Tytuł pozycji:
Investigation of the YY1 interaction with specific and non-specific DNA sequence: comparative study
- Tytuł:
-
Investigation of the YY1 interaction with specific and non-specific DNA sequence: comparative study
Badanie oddziaływania białka YY1 ze specyficzną i niespecyficzną sekwencją DNA. Analiza porównawcza
- Autorzy:
-
Jeżowski, Jakub
- Słowa kluczowe:
-
YY1, zinc fingers, DNA, specific interaction, non-specific interaction, fluorescence
YY1, palce cynkowe, DNA, oddziaływanie specyficzne, oddziaływanie niespecyficzne, fluorescencja
- Język:
-
polski
- Dostawca treści:
-
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
-
Przejdź do źródła Link otwiera się w nowym oknie
YY1 is a transcription factor involved in the repression and promotion of many genes. YY1 protein contains two domains – DBD (DNA-binding domain, residues from 295 to 414) and NTF (N-terminal fragment, residues 1-294). DBD domain has four zinc finger structural motifs which interact with DNA and other proteins.This paper aims to use single residue substitution with tryptophan to study the interaction between zinc fingers and DNA. Specifically, this model should be used to investigate the difference between the specific and non-specific interaction of YY1 with DNA.
YY1 jest czynnikiem transkrypcyjnym zaangażowanym w hamowanie i aktywację ekspresji wielu genów. Białko YY1 zawiera dwie domeny – DBD (DNA-binding domain, reszty aminokwasowe od 295 do 414) oraz NTF (N-terminal fragment, reszty 1-294). Domena DBD posiada cztery motywy palców cynkowych, które biorą udział w wiązaniu białka do DNA oraz innych białek.Poniższa praca ma na celu wykorzystanie jednotryptofanowych mutantów do badania oddziaływania palców cynkowych z DNA, w szczególności użycie ich do zbadania oddziaływania wspomnianego białka ze specyficznie rozpoznawanymi sekwencjami DNA oraz sekwencjami niespecyficznymi.
