Problemy analityczne występujące podczas oznaczania mikroorganizmów w osadzie czynnym metodą FISH

Do prawidłowej pracy biologicznych oczyszczalni ścieków niezbędny jest efektywny monitoring składu biocenozy biorącej udział w procesach oczyszczania. Stosowane do tej pory mikroskopy świetlne nie dostarczają informacji na temat konkretnych form bakterii obecnych w osadzie czynnym odpowiedzialnych za redukcję głównie form azotu i fosforu. Aktualnie do identyfikacji mikroorganizmów osadu czynnego stosowane są metody molekularne wykorzystujące mikroskopię fluorescencyjną lub konfokalną, które dają m.in. możliwość wizualizacji morfotypu, charakterystyki wzrostu oraz rozmieszczenia przestrzennego komórek w złożonych strukturach. W artykule przedstawiono charakterystykę metody FISH (Jluorescence in situ hibridization), zwracając szczególnie uwagę na problemy, które mogą się pojawić podczas oznaczeń. Wdrożenie metody FISH do monitoringu laboratoryjnego zmian składu biocenozy osadu czynnego w czasie eksploatacji oczyszczalni ścieków jest uzasadnione pomimo problemów analitycznych.

---

Biological wastewater treatment plants need effective monitoring of microorganisms taking part in the treatment process. Light microscopes do not provide information on specific forms of bacteria presented in the sludge, mainly responsible for the reduction of nitrogen and phosphorus. Nowadays, molecular methods using fluorescence or confocal microscopy, play an important role in the identification of the microorganisms constituting activated sludge. This makes it possible to visualize morphotype, the growth characteristics and spatial distribution of cells in complex structures. The paper presents the characteristics of the FISH (fluorescence in situ hybridization) method with particular attention to the problems that may arise during the identification. In spite of analytical problems, implementation of the FISH method for monitoring changes in the activated sludge composition during operation is justified.