Tytuł pozycji:
The phylogenetic effective sample size and jumps
The phylogenetic effective sample size is a parameter that has as its goal the quantification of the amount of independent signal in a phylogenetically correlated sample. It was studied for Brownian motion and Ornstein-Uhlenbeck models of trait evolution. Here, we study this composite parameter when the trait is allowed to jump at speciation points of the phylogeny. Our numerical study indicates that there is a non-trivial limit as the effect of jumps grows. The limit depends on the value of the drift parameter of the Ornstein-Uhlenbeck process.
Filogenetyczny faktyczny rozmiar próby jest to pojęcie, które zaproponowano w charakterystyce zjawisk zachodzących w biologii ewolucyjnej. Pojęcie to ma za cel uchwycenie liczby niezależnych obserwacji w próbce skorelowanej poprzez strukturę filogenetyczną. Parametr ten był już badany dla procesów Wienera oraz Ornsteina-Uhlenbecka jako modeli ewolucji cechy ciągłej. W niniejszej pracy te modele są rozszerzone o skoki ewolucyjne w rozgałęzieniach drzewa filogenetycznego. Przeprowadzona analiza numeryczna wskazuje, że istnieje nietrywialna granica, gdy skoki cechy ciągłej całkowicie wpływają na jej rozwój. Granica ta zależy od wartości współczynnika dryfu procesu Ornsteina-Uhlenbecka.
Opracowanie rekordu w ramach umowy 509/P-DUN/2018 ze środków MNiSW przeznaczonych na działalność upowszechniającą naukę (2018).
