Complex-Network-Based Methodology For Analysis Of Biomedical Data

Following the rapid growth of high-detailed information on genomes and proteomes, methods for deducing properties of living organisms at the system level are in need. One approach for capturing the global characteristics of biological entities is to model them as complex networks. Such networks can then be analysed with descriptors tailored to reveal their static and dynamic properties. With metabolic and protein-protein interaction networks of two bacteria as examples, we show here the methodology for carrying such an analysis using a set of informative descriptors.

---

Wraz ze wzrostem ilości zgromadzonych informacji o genomie i proteomie, wzrasta zapotrzebowanie na metody pozwalające na wnioskowanie o cechach badanego organizmu na poziomie systemowym. Jedno z podejść do tego problemu ujmuje globalne cechy organizmu jako złożoną sieć. Może ona być następnie analizowana przy pomocy deskryptorów zaprojektowanych pod kątem uwypuklania statycznych oraz dynamicznych cech systemu. Bazując na przykładach dotyczących sieci metabolicznych oraz zbudowanych w oparciu o interakcje białek dla dwóch mikroorganizmów, w niniejszej pracy prezentujemy metodologię analizy opartej na deskryptorach sieci złożonych.