Charakterystyka genetyczna niemieckich szczepów wirusa RHD (rabbit haemorrhagic disease)

Celem obecnej pracy była charakterystyka genetyczna pięciu niemieckich szczepów wirusa RHD (Eisenhuttenstadt, Erfurt, Frankfurt, Rossi, Wika), w oparciu o wyniki analiz molekularnych fragmentu o długości 510 nukleotydów, kodującego N-końcową część białka strukturalnego VP60. Analiza genetyczna na podstawie wygenerowanych drzew filogenetycznego i homologii wskazuje na stosunkowo niewielką zmienność szczepów w obrębię badanej sekwencji, która wynosiła 1-8%. Zaznaczyć jednak należy, że pomiędzy grupą I tworzoną przez szczepy Rossi i Wika), a grupą drugą, w której znajdują się pozostałe analizowane szczepy niemieckie (Eisenhuttenstadt, Erfurt, Frankfurt) widać dystans genetyczny.

---

The aim of the study was genetic characteristic of five German strains of RHD virus (Eisenhuttenstadt, Erfurt, Frankfurt, Rossi, Wika) on the basis on molecular analysis of a 510 bp fragment, coding N-terminal part of structural VP60. The analysis was conducted to lead to determine the phylogenetic dependence of chosen RHD strains. The analysis of five German strains of RHD virus showed that the changeability of those strains is Low, ranging from l to 8%. Nevertheless there is a need to emphasize, that between the first group consisting of Rossi and Wika and the second group with all others analyzed strains from German (Eisenhuttenstadt, Erfurt, Frankfurt) the genetic distance is visible.