Network simulation of the post-translational modifications in organic nanostructures

In this paper the paradigm for simulation of post-translational conformation in the polymer chain of amino acids, in a dynamic of the protein torsion angles aspect is discussed. The polypeptide synthesized in the ribosome is modeled using torsion angles as a degrees of freedom. The model construction paradigm for modelling of the post translational modifications (conformations) by dynamic programming is presented. The computer network structure contains a worstation fulfiling the needs of graphical User Inteface , and a supercomputer working under control of the workstation to fulfill the numerical tasks of the model implementation

---

W pracy przedstawiono metodę symulacji potranslacyjnych konformacji łańcucha polimeru aminokwasów w aspekcie kątów torsyjnych przyjętych jako stopnie swobody układu. Przedstawiono konstrukcję modelu dla określenia konformacji potranslacyjnych metodą programowania dynamicznego. Model sieciowy, bazujący na wymianie komunikatów, zbudowany został w konfiguracji stacji roboczej spełniającej zadania graficznego interfejsu użytkownika i sterowania oraz superkomputera realizującego czasochłonne procedury numeryczne.