Tytuł pozycji:
Inputs for UNRES/MREMD calculations, parameters of the cross-link potentials, and structures modeled with UNRES subject to cross-link restraints.
- Tytuł:
-
Inputs for UNRES/MREMD calculations, parameters of the cross-link potentials, and structures modeled with UNRES subject to cross-link restraints.
- Autorzy:
-
Leśniewski, Mateusz
Pyrka, Maciej
Czaplewski, Cezary
Truong Co, Nguyen
Jiang, Yida
Gong, Zhou
Tang, Chun
Liwo, Adam
- Współwytwórcy:
-
Ślusarz, Rafał
- Wydawca:
-
RepOD
- Tematy:
-
Chemistry
- Dostawca treści:
-
Repozytorium Otwartych Danych
-
Przejdź do źródła Link otwiera się w nowym oknie
These are inputs, parameters ans structures obtained from assessment of two restraint potentials for coarse-grained chemical-cross-link-assisted modeling of protein structures.
Inputs: a sample slurm script to run the parallel implementation of UNRES and UNRES input files for all calculations referred to in the paper.
Parameters: UNRES force-field parameters, the parameters of MD-based cross-link potentials.
Structures: PDB files of the sample structures shown in the paper.
