Zróżnicowanie DNA mitochondrialnego Bombina variegata na Bałkanach

The aim of this study was to obtain the full sequence of the Bombina variegata scabra (Greece – Nestos – no. ZAPUJ 3403) mitochondrial genome and to identify the differentiation within the Rhodope group (RD) from the Balkan-Western group (BW) by studying the next sequence of the fire-bellied toad from Rhodopes - Bombina variegata scabra and comparing it with the other new sequences of B. v. scabra from Balkans and B. v. variegata from Carpathians Mountains. The mtDNA studies have shown that the length of genes and their organisation in Bombina variegata does not differ from general organisation of mitochondrial genes among vertebrates. The variation of mtDNA (without CR) among Bombina variegata in the Balkans expressed as K2P (%) is the largest, with about 7%, between the Carpathian and the Balkan group, which includes both the Balkano-Western (BW) and the Rhodope group (RD). However, within individual groups (Carpathian, Balkano-Western, Rhodopean, Apennine) the variation of mtDNA is small and ranges between K2P=0.03-1%. Phylogenetic analyses showed that the most distinct group is the group of lowland fire-bellied toads (B. bombina). The mtDNA differentiation between B. bombina and B. variegata is K2P = ~9%. This group is the external group that was used for rooting the tree. A separate group is the Carpathian group, which is a sister group to the B. variegata from the Balkano-Western (BW), Rhodope (RD) and Apennines. The sister group for the whole Balkan group, which includes the Rhodopean group and the Balkano-Western group, is the Apennine group, which consist of two representatives of B. v. pachypus (Prato – Northern Apennines, Stilo – Southern Apennines).

Celem badań było uzyskanie pełnej sekwencji genomu mitochondrialnego Bombina variegata scabra (Grecja – Nestos – nr ZAPUJ 3403) oraz poznanie zróżnicowania w obrębie grupy rodopskiej (RD) w stosunku do grupy bałkańsko-zachodniej (BW), dzięki poznaniu kolejnej sekwencji kumaka z Rodopów i porównania jej z innymi nowymi sekwencjami kumaków górskich B. v. scabra z Bałkanów oraz B. v. variegata z Karpat.Badania mtDNA wykazały, że długość genów oraz ich organizacja, czyli kolejność genów, u kumaków górskich nie odbiega od ogólnej organizacji genów mitochondrialnych wśród kręgowców. Zróżnicowanie mtDNA (bez CR) wśród kumaków górskich na Bałkanach wyrażone jako K2P (%) jest największe pomiędzy grupą karpacką a bałkańską, do której należy zarówno grupa bałkańsko-zachodnia (BW) jak i rodopska (RD) i wynosi około 7%. Natomiast w obrębie poszczególnych grup (grupy karpackiej, bałkańsko-zachodniej, rodopskiej, apenińskiej) zróżnicowanie mtDNA jest niewielkie i waha się pomiędzy K2P= 0.03-1%. Analizy filogenetyczne wykazały, że najbardziej odrębną grupą jest grupa kumaków nizinnych (B. bombina). Zróżnicowanie mtDNA pomiędzy kumakami górskimi (B. variegata) a kumakami nizinnymi (B. bombina) wynosi K2P= ~9%. Grupa ta stanowi grupę zewnętrzną, która została wykorzystana do ukorzenienia drzewa. Odrębną grupę stanowi grupa karpacka, która jest grupą siostrzaną zarówno dla kumaków z grupy bałkańsko-zachodniej (BW), rodopskiej (RD) oraz kumaków z grupy apenińskiej. Z kolei grupę siostrzaną dla całej grupy bałkańskiej, do której należy grupa rodopska oraz grupa bałkańsko-zachodnia, stanowi grupa apenińska, do której należy dwóch przedstawicieli: B. v. pachypus (Prato – Apeniny Północne, Stilo – Apeniny Południowe).