KHNYN protein as a regulator of cell stress response and proliferation

The KHNYN is an enigmatic protein. It contains the KH domain responsible for the interaction with nucleic acids, the NYN domain with endonuclease activity and the CUBAN domain, which determines the interaction with ubiquitin and the NEDD8 protein. Scientific studies on the KHNYN protein indicate its participation in the defense of cells against viruses. KHNYN in interaction with the ZAP and TRIM25 proteins inhibit HIV 1 replication by degrading its RNA. The following work focuses on the KHNYN protein as a regulator of cellular stress response and the impact of KHNYN on cell proliferation. Thanks to the creation of appropriate protein constructs and the use of fluorescence and phase-contrast microscopy methods, it was shown that overexpression of the KHNYN protein causes a significant decrease in the amount of stress granules in cells exposed to sodium arsenite. The NYN domain in the KHNYN protein seems to be important for interaction with stress granules. Moreover, overexpression of the KHNYN protein in cells significantly reduces the ability of cells to proliferate and survive. In this case also the NYN domain is essential to maintain the effect of the KHNYN protein on cell proliferation and survival.

KHNYN jest mało poznanym białkiem. Posiada ono domenę KH, odpowiedzialną za oddziaływanie z kwasami nukleinowymi, domenę NYN o aktywności endonukleazowej oraz domenę CUBAN, która warunkuje oddziaływanie z ubikwityną i białkiem NEDD8. Prace poświęcone białku KHNYN wskazują na jego udział w obronie komórek przed wirusami. KHNYN wraz z białkami ZAP oraz TRIM25 powodują zahamowanie replikacji wirusa HIV 1 poprzez degradację jego RNA.Niniejsza praca skupia się na białku KHNYN, jako regulatorze odpowiedzi komórki na stres oraz na wpływie KHNYN na proliferację komórek. Dzięki stworzeniu odpowiednich konstruktów białkowych oraz przy zastosowaniu metod mikroskopii fluorescencyjnej i kontrastowo-fazowej sprawdzono wpływ nadekspresji białka KHNYN na ilość granul stresowych w komórkach poddanych działaniu arseninu sodu. Zanalizowano również istotność domeny NYN białka KHNYN w tym procesie. Ponad to określono wpływ białka KHNYN na zdolność komórek do proliferacji i przeżycia.