Eksploracja rozpoznawania substratu przez proteazy cysteinowe metodami obliczeniowymi

Celem tej pracy było zbadanie działania proteaz w celu późniejszego wykorzystania tych danych do tworzenia PluriZymów w przyszłości. Udało się to osiągnąć dzięki wykorzystaniu PELE (Protein Energy Landscape Exploration), nowatorskiej metody przeprowadzania badań krajobrazu energetycznego białek. Papaina była wykorzystana do przeprowadzenia symulacji, a wyniki porównano z danymi eksperymentalnymi.

The aim of this study was to explore the mechanism of action of proteases in order to later implement this data into creating PluriZymes in the future. It was achieved with the use of PELE (Protein Energy Landscape Exploration), a novel method to perform protein energy landscape explorations. Papain was used in simulations and the results were compared with experimental data.