Tytuł pozycji:
Comparison of the expression profile of the selected genes in the skin of mice MCPIP1CKO and MCPIP1WT
- Tytuł:
-
Comparison of the expression profile of the selected genes in the skin of mice MCPIP1CKO and MCPIP1WT
Porównanie profilu ekspresji wybranych genów w skórze u myszy MCPIP-1CKO oraz MCPIP-1WT
- Autorzy:
-
Pocałuń, Natalia
- Słowa kluczowe:
-
MCPIP1, MCPIP1EKO skin, epidermis, dermis, mice, qRT-PCR, RNA-seq, gene expression profile, transcriptome sequencing, keratinocytes, regulation of gene expression, Regnase-1, Zc3h12a, Lcn2, Slc6a14, Stfa3, Fabp5, Prss27, Slc16a6, Ciart, Bcat1
MCPIP1, MCPIP1EKO, Regnaza-1, skóra, naskórek, skóra właściwa, myszy, keratynocyty, qRT-PCR, RNA-seq, profilowanie transkryptomiczne, profil ekspresji genów, regulacja ekspresji genów, Zc3h12a, Lcn2, Slc6a14, Stfa3, Fabp5, Prss27, Slc16a6, Ciart, Bcat1
- Język:
-
polski
- Dostawca treści:
-
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
-
Przejdź do źródła Link otwiera się w nowym oknie
MCPIP1 has a broad spectrum of biological activity. Main function of this protein is the regulation of inflammation through the degradation of the pro-inflammatory cytokine transcripts: IL-1β and IL-6. Inflammation can be also regulated by inhibiting of the NFκB transcription factor, a pivotal activator of inflammation. The role of Regnase-1 has also been confirmed in the cell differentiation, tumor development, adipogenesis, angiogenesis and in the antivirus response. The aim of this thesis is verification of transcriptomic analyzes (RNA-seq) using the qRT-PCR technique. The analysis was extended by a different age group, and the epidermis and dermis from different locations of the mice skin MCPIP1EKO vs. MCPIP1WT.
RNaza MCPIP1 dzięki swojemu szerokiemu spektrum działania uczestniczy w wielu procesach biologicznych. Jego główną funkcją jest regulacja stanów zapalnych przez degradację transkryptów wielu cytokin prozapalnych tj IL-1β oraz IL-6. Stan zapalny może również regulować poprzez hamowanie aktywacji czynnika transkrypcyjnego NFκB- kluczowego aktywatora stanu zapalnego. Rolę Regnzazy-1 potwierdzono także w różnicowaniu komórek, rozwoju nowotworów, adipogenezie, angiogenezie oraz w odpowiedzi przeciwwirusowej. W niniejszej pracy przeprowadzono ewaluację wyników analiz transkryptomicznych za pomocą metody qRT-PCR oraz analizowano wpływ białka MCPIP1 na poziom ekspresji wybranych genów w skórze u myszy w różnym wieku z warunkowym nokautem genu Zc3h12a w keratynocytach.
