Temat: structure prediction

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: MOFOID - not only the protein modeling server.
Autorzy:: Szczesny, Pawel
Wieczorek, Grzegorz
Zielenkiewicz, Piotr
Data publikacji:: 2005
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: protein structure prediction
homology modeling; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Conformational subspace in simulation of early‐stage protein folding
Autorzy:: Konieczny, Leszek
Wiśniowski, Zdzisław
Jurkowski, Wiktor
Bryliński, Michał
Roterman-Konieczna, Irena
Data publikacji:: 2004
Słowa kluczowe:: information
structural entropy
protein structure prediction; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 3.

Tytuł:: Smotifs as structural local descriptors of supersecondary elements: classification, completeness and applications
Autorzy:: Bonet, J.
Fiser, A.
Oliva, B.
Fernandez-Fuentes, N.
Data publikacji:: 2014
Słowa kluczowe:: loop structure prediction
protein loops
protein secondary structures
protein structure design
protein structure prediction
protein supersecondary structures; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 4.

Tytuł:: Improving protein structure prediction, refinement and quality assessment techniques
Autorzy:: Leelananda, S. P.
Pawłowski, M.
Faraggi, E.
Kloczkowski, A.
Data publikacji:: 2014
Wydawca:: Politechnika Gdańska
Tematy:: protein structure prediction
model quality assessment
structure refinement; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 5.

Tytuł:: Opportunities and limitations in applying coevolution-derived contacts to protein structure prediction
Autorzy:: Tetchner, S.
Kosciolek, T.
Jones, D. T.
Data publikacji:: 2014
Słowa kluczowe:: contact prediction
correlated mutation analysis
protein structure prediction; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 6.

Tytuł:: Artificial Bee Colony Algorithm for the Protein Structure Prediction Based on the Toy Model
Autorzy:: Li, Y.
Zhou, C.
Zheng, X.
Data publikacji:: 2015
Słowa kluczowe:: protein structure prediction
ABC algorithm
Fibonacci sequences; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 7.

Tytuł:: Dissimilar sequence: similar structure of proteins
Autorzy:: Banach, M.
Konieczny, L.
Roterman, I.
Data publikacji:: 2016
Słowa kluczowe:: hydrophobicity
protein structure
protein structure prediction
secondary structure; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 8.

Tytuł:: Limitation of conformational space for proteins -- early stage folding simulation of human alpha and beta hemoglobin chains
Autorzy:: Bryliński, M.
Jurkowski, W.
Konieczny, L.
Roterman, I.
Data publikacji:: 2004
Wydawca:: Politechnika Gdańska
Tematy:: early-stage folding
structure prediction
conformational space; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 9.

Tytuł:: Limitation of conformational space for proteins -- early stage folding simulation of human alpha and beta hemoglobin chains
Autorzy:: Bryliński, M.
Jurkowski, W.
Konieczny, L.
Roterman, I.
Data publikacji:: 2004
Słowa kluczowe:: early-stage folding
structure prediction
conformational space; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 10.

Tytuł:: Limitation of conformational space for proteins : early stage folding simulation of human $\alpha$ and $\beta$ hemoglobin chains
Autorzy:: Roterman-Konieczna, Irena
Bryliński, Michał
Konieczny, Leszek
Jurkowski, Wiktor
Data publikacji:: 2004
Słowa kluczowe:: structure prediction
early-stage folding
conformational space; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 11.

Tytuł:: The thermodynamics of biomolecular sequences
Autorzy:: Dewey T. G.
Tematy:: structure prediction
thermodynamics
biopolymer
polymer configuration
polymer statistics; Pokaż więcej
Dostawca treści:: AGRO

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 12.

Tytuł:: A method of predicting the secondary protein structure based on dictionaries
Autorzy:: Roterman-Konieczna, I.
Fabian, P.
Stąpór, K.
Data publikacji:: 2015
Słowa kluczowe:: protein secondary structure prediction
statistical dictionary
structural code; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 13.

Tytuł:: SSTMProt, a point mutation sensitive tool to combine results and to predict the consensus sequence, and secondary structure of transmembrane proteins
Autorzy:: Jastrzębski, J. P.
Data publikacji:: 2011
Słowa kluczowe:: secondary structure
structure prediction
transmembrane protein
bioinformatics
sensitivity
algorithm; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 14.

Tytuł:: New functionality of RNAComposer: an application to shape the axis of miR160 precursor structure
Autorzy:: Antczak, Maciej
Popenda, Mariusz
Zok, Tomasz
Sarzynska, Joanna
Ratajczak, Tomasz
Tomczyk, Katarzyna
Adamiak, Ryszard
Szachniuk, Marta
Data publikacji:: 2016
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: RNA 3D structure prediction
RNAComposer
plant miRNA precursor; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 15.

Tytuł:: On the need to introduce environmental characteristics in ab initio protein structure prediction using a coarse-grained UNRES force field
Autorzy:: Roterman-Konieczna, Irena
Konieczny, Leszek
Sieradzan, Adam
Stapor, Katarzyna
Wesołowski, Patryk
Data publikacji:: 2022
Słowa kluczowe:: misfolding in prediction
protein folding
hydrophobic core
water environment
protein structure prediction; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 16.

Tytuł:: Przewidywanie struktury drugorzędowej białek metodą słownikową
Autorzy:: Fabian, P.
Stąpor, K.
Data publikacji:: 2014
Słowa kluczowe:: proteins
secondary structure
structure prediction
białka
struktura drugorzędowa
przewidywanie struktury; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 17.

Tytuł:: Exact methods for lattice protein models
Autorzy:: Mann, M.
Backofen, R.
Data publikacji:: 2014
Słowa kluczowe:: CPSP
HP-model
lattice protein
optimal structure
protein structure prediction; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 18.

Tytuł:: 3D-Judge : a metaserver approach to protein structure prediction
Autorzy:: Jaśkowski, W.
Błażewicz, J.
Łukasiak, P.
Miłostan, M.
Krasnogor, N.
Data publikacji:: 2007
Słowa kluczowe:: protein structure prediction
neural network
meta-server
protein structure similarity; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 19.

Tytuł:: Structural role of hydrophobic core in proteins-selected examples
Autorzy:: Roterman-Konieczna, Irena
Kalinowska, B.
Konieczny, Leszek
Banach, Mateusz
Data publikacji:: 2016
Słowa kluczowe:: evolution
structure alignment
hydrophobicity
structural differences
structure comparison
structure prediction
protein folding; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 20.

Tytuł:: Cytomegalovirus immediate early gene UL37 encodes a novel MHC-like protein
Autorzy:: Wyrwicz, Lucjan
Rychlewski, Leszek
Data publikacji:: 2008
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: Betaherpesvirinae
CMV
protein structure prediction
MHC I class
bioinformatics
apoptosis; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 21.

Tytuł:: The data from GeneSilico MetaServer for CASP10 (2012) targets
Autorzy:: Kozlowski, Lukasz
Bujnicki, Janusz
Wydawca:: RepOD
Tematy:: Medicine, Health and Life Sciences
protein
protein structure prediction
CASP; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Otwartych Danych

Inne

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 22.

Tytuł:: The data from GeneSilico MetaServer for CASP9 (2010) targets
Autorzy:: Kozlowski, Lukasz
Bujnicki, Janusz
Wydawca:: RepOD
Tematy:: Medicine, Health and Life Sciences
protein
protein structure prediction
CASP; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Otwartych Danych

Inne

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 23.

Tytuł:: The data from GeneSilico MetaServer for CASP11 (2014) targets
Autorzy:: Kozlowski, Lukasz
Bujnicki, Janusz
Wydawca:: RepOD
Tematy:: Medicine, Health and Life Sciences
protein
CASP
proteins structure prediction; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Otwartych Danych

Inne

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 24.

Tytuł:: The data from GeneSilico MetaServer for CASP7 (2006) targets
Autorzy:: Kozlowski, Lukasz
Bujnicki, Janusz
Wydawca:: RepOD
Tematy:: Medicine, Health and Life Sciences
protein
protein structure prediction
CASP; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Otwartych Danych

Inne

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 25.

Tytuł:: The data from GeneSilico MetaServer for CASP6 (2004) targets
Autorzy:: Kozlowski, Lukasz
Bujnicki, Janusz
Wydawca:: RepOD
Tematy:: Medicine, Health and Life Sciences
protein
protein structure prediction
CASP; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Otwartych Danych

Inne

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 26.

Tytuł:: Sequence analysis and structure prediction of aminoglycoside-resistance 16S rRNA:m7G methyltransferases
Autorzy:: Bujnicki J.M.
Rychlewski L.
Tematy:: methyltransferase
RNA
structure prediction
regulation
aminoglycoside antibiotic
maturation
aminoglycoside resistance
methylation; Pokaż więcej
Dostawca treści:: AGRO

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 27.

Tytuł:: Size, shape and secondary structure of calponin.
Autorzy:: Czuryło, Edward
Eimer, Wolfgang
Kulikova, Natalia
Hellweg, Thomas
Data publikacji:: 2000
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: dynamic light scattering
secondary structure prediction
calponin
circular dichroism
secondary structure estimation; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 28.

Tytuł:: Protein modeling and structure prediction with a reduced representation.
Autorzy:: Kolinski, Andrzej
Data publikacji:: 2004
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: Monte Carlo simulations
structure prediction
comparative modeling
lattice proteins
protein folding; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 29.

Tytuł:: Motifs of the caldesmon family.
Autorzy:: Czuryło, Edward
Data publikacji:: 2000
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: secondary structure prediction
caldesmon
binding sites
conserved sequences
multiple sequence alignment; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 30.

Tytuł:: Improving protein structure prediction, refinement and quality assessment techniques
Autorzy:: Leelananda, S. P.
Pawłowski, M.
Faraggi, E.
Kloczkowski, A.
Data publikacji:: 2014
Słowa kluczowe:: protein structure prediction
model quality assessment
structure refinement
przewidywanie struktury białek
ocena jakości modeli; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 31.

Tytuł:: Homologues of HSV-1 nuclear egress factor UL34 are potential phosphoinositide-binding proteins
Autorzy:: Wyrwicz, Lucjan
Koczyk, Grzegorz
Rychlewski, Leszek
Data publikacji:: 2008
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: HSV-1
Herpesviridae
phosphoinositides
protein structure prediction
bioinformatics
UL34
nuclear egress; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 32.

Tytuł:: On the Hardness of Energy Minimisation for Crystal Structure Prediction
Autorzy:: Adamson, Duncan
Deligkas, Argyrios
Gusev, Vladimir
Potapov, Igor
Data publikacji:: 2021
Słowa kluczowe:: Energy Minimisation
Graph theory, Euclidean Graphs
NP-Hard Problems
Crystal Structure Prediction; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 33.

Tytuł:: Crystal Structure Prediction and Charge Density Distribution of Highly Energetic Dimethylnitraminotetrazole: a First Step for the Design of High Energy Density Materials
Autorzy:: Arputharaj, D. S.
Srinivasan, P.
Asthana, S. N.
Pawar, R. B.
Kumaradhas, P.
Data publikacji:: 2012
Wydawca:: Sieć Badawcza Łukasiewicz - Instytut Przemysłu Organicznego
Tematy:: energetic materials
crystal structure prediction
charge density analysis
atoms in molecules
electrostatic potential; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 34.

Tytuł:: A new approach to homology modeling
Autorzy:: He, Y.
Scheraga, H. A.
Rackovsky, S.
Data publikacji:: 2022-02-01
Wydawca:: Politechnika Gdańska
Tematy:: protein structure prediction
physical properties
Kidera factors
Fourier transformation
coarse-grained force field; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 35.

Tytuł:: Protein modelling and structure prediction with a reduced representation
Autorzy:: Kolinski A.
Tematy:: protein modelling
protein folding
structure prediction
comparative modelling
lattice protein
Monte Carlo simulation; Pokaż więcej
Dostawca treści:: AGRO

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 36.

Tytuł:: Crystal Structure Prediction and Charge Density Distribution of Highly Energetic Dimethylnitraminotetrazole: a First Step for the Design of High Energy Density Materials
Autorzy:: Arputharaj, D. S.
Srinivasan, P.
Asthana, S. N.
Pawar, R. B.
Kumaradhas, P.
Data publikacji:: 2012
Słowa kluczowe:: energetic materials
crystal structure prediction
charge density analysis
atoms in molecules
electrostatic potential; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 37.

Tytuł:: Motifs of the caldesmon family
Autorzy:: Czurylo E. A.
Tematy:: caldesmon
secondary structure prediction
protein
multiple sequence alignment
smooth muscle
conserved sequence
binding site; Pokaż więcej
Dostawca treści:: AGRO

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 38.

Tytuł:: Structure of Proteins : New Approach to Molecular Modeling
Autorzy:: Koliński, A.
Rotkiewicz, P.
Skolnick, J.
Data publikacji:: 2001
Słowa kluczowe:: protein folding
lattice protein models
comparative modeling
loop modeling
Monte Carlo simulation
protein structure prediction; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 39.

Tytuł:: Structure of elusive crystal forms of meloxicam
Autorzy:: Dudek, Marta
Współwytwórcy:: Marta Dudek
Data publikacji:: 2025-03-25
Wydawca:: RepOD
Tematy:: Chemistry
Medicine, Health and Life Sciences
solid-state NMR
meloxicam
Crystal structure prediction
elusive polymorphs; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Otwartych Danych

Inne

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 40.

Tytuł:: Homologues of HSV-1 nuclear egress factor UL34 are potential phosphoinositide-binding proteins
Autorzy:: Wyrwicz L.S.
Koczyk G.
Rychlewski L.
Tematy:: herpesvirus
protein
protein structure prediction
nucleus
nuclear egress
Herpesviridae
DNA replication
bioinformatics
phosphoinositide
replication cycle; Pokaż więcej
Dostawca treści:: AGRO

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 41.

Tytuł:: Sequence analysis of the cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit-like protein from Trypanosoma brucei
Autorzy:: Araujo N.A.
Bubis J.
Tematy:: cAMP-dependent protein kinase
leucine-rich repeat
structure prediction
Trypanosoma brucei
amino acid sequence
sequence analysis; Pokaż więcej
Dostawca treści:: AGRO

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 42.

Tytuł:: Protein secondary structure prediction based on amino acid sequence using SVM and its parameters optimalization
Przewidywanie drugorzędowej struktury białek na podstawie ich sekwencji aminokwasowej z wykorzystaniem SVM i algorytmu optymalizacji jego parametrów
Autorzy:: Stepanko, Tomasz
Słowa kluczowe:: białka struktura klasyfikacja przewidywanie macierz
proteins structure classification prediction matrix; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego

Inne

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 43.

Tytuł:: Is the growth rate of Protein Data Bank sufficient to solve the protein structure prediction problem using template-based modeling?
Autorzy:: Bryliński, M.
Data publikacji:: 2015
Słowa kluczowe:: comparative modeling
COMPASS
HHpred
Protein Data Bank
protein fold recognition
protein structure prediction
protein threading
template-based modeling; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 44.

Tytuł:: Identification of the physiological function of the Q2T8S1 protein from Burkholderia thailandensis
Identyfikacja funkcji fizjologicznej białka Q2T8S1 z Burkholderia thailandensis
Autorzy:: Przybyłowska, Martyna
Słowa kluczowe:: Crystallization; Crystallization conditions; Protein structure; Prediction of protein function
Krystalizacja; Warunki krystalizacji; Struktura białka; Przewidywanie funkcji białka; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego

Inne

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 45.

Tytuł:: The mRNA sequence polymorphisms of flowering key genes in bolting sensitive or tolerant sugar beet genotypes
Autorzy:: Alimirzaee, M.
Mirzaie-Asl, A.
Abdollahi, M.R.
Kolaei, H.E.
Fasahat, P.
Data publikacji:: 2017
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: sugar-beet
Beta vulgaris ssp.maritima
mRNA
polymorphism
flowering
single nucleotide polymorphism
genetic control
RNA extraction
protein structure prediction; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 46.

Tytuł:: Characterization and analyses of hydrophobic clusters, acetylation and myristoylation sites in plant glutathione peroxidase sequences
Autorzy:: Ganguli S.
Polley A.
Datta A.
Tematy:: cluster analysis
hydrophobic cluster
glutathione peroxidase
peroxidase
post transcriptional gene silencing
protein structure
protein structure prediction
reactive oxygen species
acetylation
myristoylation; Pokaż więcej
Dostawca treści:: AGRO

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 47.

Tytuł:: Implementation and evaluation of new protocol for comparative modeling of protein structures
Autorzy:: Strumillo, M.
Dawid, A. E.
Szczasiuk, A.
Gront, D.
Data publikacji:: 2014
Wydawca:: Politechnika Gdańska
Tematy:: protein structure prediction
comparative modeling
protein threading
protein alignment
BioShell
Rosetta
przewidywanie struktury białek
modelowanie porównawcze
gwintowania białka
wyrównanie białka; Pokaż więcej
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 48.

Tytuł:: Implementation and evaluation of new protocol for comparative modeling of protein structures
Autorzy:: Strumillo, M.
Dawid, A. E.
Szczasiuk, A.
Gront, D.
Data publikacji:: 2014
Słowa kluczowe:: protein structure prediction
comparative modeling
protein threading
protein alignment
BioShell
Rosetta
przewidywanie struktury białek
modelowanie porównawcze
gwintowania białka
wyrównanie białka; Pokaż więcej
Dostawca treści:: BazTech

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 49.

Tytuł:: The mRNA sequence polymorphisms of flowering key genes in bolting sensitive or tolerant sugar beet genotypes
Autorzy:: Alimirzaee M.
Mirzaie-Asl A.
Abdollahi M.R.
Kolaei H.E.
Fasahat P.
Tematy:: sugar-beet
Beta vulgaris ssp.maritima
mRNA
polymorphism
flowering
single nucleotide polymorphism
genetic control
RNA extraction
protein structure prediction; Pokaż więcej
Dostawca treści:: AGRO

Artykuł

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 50.

Tytuł:: Cytomegalovirus immediate early gene UL37 encodes a novel MHC-like protein
Autorzy:: Wyrwicz L.S.
Rychlewski L.
Tematy:: protein structure prediction
human disease
human cytomegalovirus
gene
apoptosis
cytomegalovirus
major histocompatibility complex-like protein
bioinformatics
gastrointestinal disease
Betaherpesvirinae; Pokaż więcej
Dostawca treści:: AGRO

Artykuł

na półce

Szczegóły

Informacja

Wyszukujesz frazę "structure prediction" wg kryterium: Temat